子科生物報(bào)道:快速抗原檢測(cè)的可用性極大地推動(dòng)了遏制COVID-19傳播的努力，但每一種新的擔(dān)憂都引發(fā)了診斷檢測(cè)是否仍然有效的問(wèn)題。發(fā)表在《細(xì)胞》雜志上的一項(xiàng)新研究試圖解決這些問(wèn)題，方法是評(píng)估在未來(lái)的SARS-CoV-2變種挑戰(zhàn)下，檢測(cè)的速度如何。

該研究團(tuán)隊(duì)由埃默里大學(xué)領(lǐng)導(dǎo)，由美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院(NIH)快速加速診斷(RADx)技術(shù)項(xiàng)目資助，開(kāi)發(fā)了一種新的方法，用于評(píng)估新冠病毒的突變?nèi)绾斡绊懣焖倏乖瓩z測(cè)中使用的抗體的識(shí)別。因?yàn)榇蠖鄶?shù)快速抗原檢測(cè)都是檢測(cè)SARS-CoV-2核衣殼蛋白(N蛋白)，該團(tuán)隊(duì)直接測(cè)量了N蛋白的突變?nèi)绾斡绊懺\斷抗體識(shí)別目標(biāo)的能力。

埃默里大學(xué)生物化學(xué)系助理教授、第一篇研究報(bào)告的作者Filipp Frank博士說(shuō):“根據(jù)我們的發(fā)現(xiàn)，令人擔(dān)憂的SARS-CoV-2的主要變體都不包含會(huì)影響當(dāng)前快速抗原檢測(cè)抗體能力的突變。此外，這些數(shù)據(jù)使我們能夠提前一步，針對(duì)可能出現(xiàn)的幾乎任何變體預(yù)測(cè)測(cè)試性能。”

該研究使用了一種稱為深度突變掃描（Deep mutational scanning）的方法，在一個(gè)單一的高通量實(shí)驗(yàn)中評(píng)估N蛋白中所有可能的突變。然后，研究人員測(cè)量了突變對(duì)它們與11種商用快速抗原檢測(cè)中使用的抗體相互作用的影響，并確定了可能導(dǎo)致抗體逃逸的突變。

埃默里大學(xué)生物化學(xué)系教授、資深研究作者Eric Ortlund博士說(shuō):“準(zhǔn)確和有效地識(shí)別受感染者仍然是減緩COVID-19的一項(xiàng)至關(guān)重要的策略，我們的研究提供了關(guān)于未來(lái)可能干擾檢測(cè)的SARS-CoV-2突變的信息。這里概述的結(jié)果可以讓我們快速適應(yīng)病毒的新變種繼續(xù)出現(xiàn)，代表著立即的臨床和公共衛(wèi)生影響?！?/p>

研究結(jié)果表明，變異中N蛋白發(fā)生突變從而躲過(guò)診斷測(cè)試的情況相對(duì)罕見(jiàn)，但有一小部分序列可能會(huì)影響檢測(cè)。研究人員、公共衛(wèi)生官員和測(cè)試制造商可以使用這些數(shù)據(jù)來(lái)確定診斷測(cè)試是否需要評(píng)估其檢測(cè)這些突變的能力，或?yàn)槲磥?lái)的測(cè)試設(shè)計(jì)提供信息。

國(guó)家生物醫(yī)學(xué)成像和生物工程研究所(NIBIB)主任、NIH RADx?技術(shù)項(xiàng)目負(fù)責(zé)人Bruce J. Tromberg博士說(shuō):“考慮到新變體的無(wú)盡循環(huán)，這項(xiàng)研究的數(shù)據(jù)在未來(lái)幾年將是有用的?！?br>

雖然許多擔(dān)憂的變體包含N蛋白的多重突變，但研究作者指出，他們的方法沒(méi)有評(píng)估多重突變?nèi)绾斡绊懺\斷抗體識(shí)別，這代表了該研究的局限性。

文章標(biāo)題

Deep mutational scanning identifies SARS-CoV-2 Nucleocapsid escape mutations of currently available rapid antigen tests