? 腎臟,這個(gè)如同精密過濾器般的器官,在維持人體正常生理功能中扮演著舉足輕重的角色,它不僅負(fù)責(zé)過濾血液、維持體液平衡,還參與多種激素的代謝調(diào)節(jié)。然而,在腎臟相關(guān)疾病的研究中,一個(gè)有趣卻又復(fù)雜的現(xiàn)象逐漸引起了科學(xué)家們的關(guān)注 —— 許多腎臟疾病的發(fā)病率和進(jìn)展存在明顯的性別差異。例如,男性患腎癌的風(fēng)險(xiǎn)相對較高,而女性似乎在某些腎臟疾病中具有一定的激素保護(hù)作用。但長期以來,這些性別差異背后的分子機(jī)制卻如同迷霧,籠罩著腎臟疾病的研究領(lǐng)域,讓科學(xué)家們難以精準(zhǔn)把握。
為了揭開這層神秘的面紗,華盛頓大學(xué)圣路易斯分校(Washington University in St. Louis)的研究人員展開了一項(xiàng)極具意義的研究。他們整合了來自六個(gè)平臺的數(shù)據(jù),對 68 只小鼠在胚胎期 16.5 天(E16.5)、出生(P0)、3 周齡、12 周齡、52 周齡和 92 周齡這六個(gè)發(fā)育和成年時(shí)間點(diǎn)的 76 個(gè)腎臟樣本進(jìn)行了全面分析,旨在構(gòu)建小鼠腎臟在整個(gè)生命周期中的分子圖譜,深入探究腎臟性別二態(tài)性的奧秘。
這項(xiàng)研究成果發(fā)表在《Nature Genetics》雜志上,為腎臟疾病的研究開辟了新的方向。研究人員通過一系列嚴(yán)謹(jǐn)?shù)膶?shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)和數(shù)據(jù)分析,得出了許多重要結(jié)論,對深入理解腎臟生理和疾病機(jī)制意義重大。
在研究方法上,研究人員運(yùn)用了多種先進(jìn)的技術(shù)手段。首先,利用單細(xì)胞測序技術(shù),包括單細(xì)胞核 RNA 測序(snRNA - seq)和單細(xì)胞核轉(zhuǎn)座酶可及染色質(zhì)測序(snATAC - seq),對腎臟細(xì)胞進(jìn)行高分辨率的基因表達(dá)和染色質(zhì)可及性分析。其次,借助 Visium 空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)(ST)和 Xenium 技術(shù),研究人員能夠在空間層面解析基因表達(dá)模式,精準(zhǔn)定位不同細(xì)胞類型在腎臟中的位置。此外,還運(yùn)用了多重成像和免疫熒光(IF)技術(shù),從蛋白質(zhì)水平驗(yàn)證基因表達(dá)差異 。在樣本選擇上,使用了 C57BL/6J 小鼠,并對不同發(fā)育階段的小鼠腎臟進(jìn)行采樣,同時(shí)也分析了人類腎臟樣本,確保研究結(jié)果的普適性。
下面來詳細(xì)看看具體的研究結(jié)果:
小鼠腎臟的綜合多組學(xué)分析:研究人員收集了不同發(fā)育階段小鼠的腎臟樣本,通過 snRNA - seq 和 snATAC - seq 獲得了 203,139 個(gè)高質(zhì)量細(xì)胞。經(jīng)過質(zhì)量控制和批次效應(yīng)校正后,對數(shù)據(jù)進(jìn)行整合分析。通過 Visium ST 技術(shù),觀察到不同發(fā)育階段腎臟細(xì)胞類型的分布變化,如胚胎期和新生兒期的細(xì)胞類型與成年期有明顯差異,且已知的腎臟分段標(biāo)記基因在空間上呈現(xiàn)出預(yù)期的分布模式。
- 青春期后 PT 中轉(zhuǎn)錄的性別二態(tài)性顯現(xiàn):在研究不同腎臟段的性別差異時(shí),發(fā)現(xiàn) PT 細(xì)胞在發(fā)育和性別差異方面表現(xiàn)出獨(dú)特的模式。3 周齡時(shí),PT 基因表達(dá)譜與后期年齡不同,且性別偏向較弱。隨著性成熟,從 3 周齡到 12 周齡,PT 中許多基因的表達(dá)模式發(fā)生顯著變化,例如 Rhobtb1 和 Ehhadh 等基因在 3 周齡時(shí)高表達(dá),隨后下降;而 Ghr 基因在 3 周齡時(shí)無表達(dá),后期則維持高水平。同時(shí),在 PT 中還鑒定出大量性別差異表達(dá)基因(DEGs),這些基因在男性和女性中的表達(dá)模式差異顯著,且在 PT(S2)和 PT(S3)段比 PT(S1)段更為明顯。
- 性別偏向的 DEGs 在 PT(S3)中最為常見:通過對上皮細(xì)胞類型的相關(guān)性分析,發(fā)現(xiàn) PT(S3)中性別偏向的 DEGs 數(shù)量最多。對這些 DEGs 進(jìn)行通路分析表明,女性在肌生成、白細(xì)胞介素 2(IL - 2) - 信號轉(zhuǎn)導(dǎo)和轉(zhuǎn)錄激活因子 5(STAT5)信號通路以及上皮 - 間質(zhì)轉(zhuǎn)化等通路中富集;男性則在異生物質(zhì)和脂肪酸代謝通路中富集。此外,還驗(yàn)證了一些已知的性別偏向基因,并發(fā)現(xiàn)了新的性別偏向基因,如 Socs2 和 Akr1c21,這些基因在蛋白質(zhì)水平也表現(xiàn)出明顯的性別差異。
- 小鼠 PT 性別二態(tài)性的分子機(jī)制:通過轉(zhuǎn)錄因子(TF)調(diào)控子活性分析,發(fā)現(xiàn) PT(S3)中許多調(diào)控子存在性別偏向,且調(diào)控子富集在 3 周齡到 12 周齡間發(fā)生顯著變化,暗示性激素的參與。研究人員提出了兩種調(diào)節(jié) PT(S3)中女性偏向 DEGs 的機(jī)制:催乳素誘導(dǎo)的 JAK2/STAT5 激活以及 STAT5/BCL6 在靶啟動子上的競爭性結(jié)合。其中,Socs2 和 Prlr 的表達(dá)可能受這兩種機(jī)制共同控制,而 Abcc3 和 Acot7 僅依賴 JAK2/STAT5 激活。
- 性別偏向的空間分布模式:利用 Xenium 平臺分析腎臟的空間表達(dá)模式,研究人員確定了腎臟的四個(gè)不同區(qū)域,并發(fā)現(xiàn)了五種性別二態(tài)性的空間表達(dá)模式。例如,Pigr 基因在男性腎臟的皮質(zhì)和外髓質(zhì)外條紋(OSOM)中高表達(dá),且在 PT(S3)的皮質(zhì)髓質(zhì)交界處達(dá)到峰值;Akr1c21 基因在男性 PT(S3)中特異性富集,在女性 OSOM 中表達(dá)急劇下降。同時(shí),參與 JAK/STAT 通路的女性偏向基因 Prlr、Jak2 和 Socs2 在女性 PT(S3)中表達(dá)較高,且在 OSOM 中呈現(xiàn)出明顯的表達(dá)峰值。
- 核受體(NRs)調(diào)節(jié) PT 中的性別偏向 DEGs:通過基序富集分析,研究人員發(fā)現(xiàn)不同性別在 PT(S2)和 PT(S3)中存在特異性的基序。例如,C/EBP 家族在女性中高度富集,而 NR1、NR2 和 NR3 在男性中富集。進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn),雄激素受體(AR)基序在男性的所有 PT 段中均有顯著較高的富集,表明雄激素直接參與了男性腎臟性別偏向基序的富集。約 14% 的男性偏向 DEGs 是 AR 基序的下游靶標(biāo)。
- 在人類中評估小鼠 PT 性別 DEGs:研究人員在人類樣本中評估了小鼠研究的發(fā)現(xiàn),結(jié)果顯示 PT 同樣是人類中具有最多性別 DEGs 的細(xì)胞類型。在小鼠和人類中,分別有 87%(906 個(gè))和 82%(796 個(gè))的性別 DEGs 表現(xiàn)出相同的趨勢,且有 135 個(gè)和 111 個(gè)重疊的 DEGs 在兩者中均顯示出大于兩倍的表達(dá)差異。通過 IF 染色和多重成像技術(shù),在蛋白質(zhì)水平驗(yàn)證了部分基因(如 SOCS2、SCD、CYP4B1 和 INMT)的性別差異。
- 衰老對腎臟不同性別細(xì)胞類型的影響:比較 92 周齡小鼠腎臟與年輕小鼠腎臟,發(fā)現(xiàn)免疫細(xì)胞在衰老腎臟中逐漸積累。在不同細(xì)胞類型中,PT 在衰老過程中表現(xiàn)出最多的基因改變,且老年雄性小鼠的差異比雌性小鼠更為顯著;而收集管主細(xì)胞(CD_PC)在雌性小鼠中表現(xiàn)出更豐富的衰老相關(guān)改變。研究還發(fā)現(xiàn),一些衰老相關(guān)基因與腎臟疾病有關(guān),如 Pappa 和 Spp1,且部分衰老 DEGs 也是性別 DEGs,這凸顯了在腎臟衰老研究中考慮性別的重要性。
在研究結(jié)論和討論部分,這項(xiàng)研究通過多組學(xué)和空間分析,全面地描繪了小鼠腎臟在整個(gè)生命周期中的性別差異,為理解腎臟性別二態(tài)性提供了深入的見解。研究發(fā)現(xiàn)的性別特異性基因表達(dá)和調(diào)控網(wǎng)絡(luò),有助于解釋腎臟疾病中性別差異的分子機(jī)制。例如,Pigr 基因在男性腎臟特定區(qū)域的高表達(dá)可能與其腎癌易感性相關(guān);Socs2 基因的表達(dá)調(diào)控機(jī)制為進(jìn)一步研究女性腎臟疾病的保護(hù)機(jī)制提供了線索。此外,研究還強(qiáng)調(diào)了在腎臟研究中納入性別因素的重要性,為未來腎臟疾病的診斷、治療和預(yù)防提供了新的思路和潛在靶點(diǎn),有望推動個(gè)性化醫(yī)療的發(fā)展,針對不同性別的患者制定更精準(zhǔn)的治療方案。總之,該研究成果為腎臟疾病領(lǐng)域的研究開辟了新的方向,具有重要的理論和臨床意義。(子科生物報(bào)道)