深圳子科生物報道：單細胞測序技術填補了生命科學領域的許多空白，依靠這項技術，康涅狄格大學健康中心和杰克遜實驗室（JAX）的研究人員已經鑒定出了40種視網膜神經節(jié)細胞（retinal ganglion cells，RGCs）亞型，以及用于區(qū)分它們的遺傳標記和轉錄因子。

得益于液滴單細胞RNA測序技術（droplet-based single-cell RNA sequencing），研究人員現(xiàn)在能單獨分離每個細胞并擴增其遺傳物質來探查RNA組成。這才允許科研人員對給定類型細胞（例如RGCs）進行詳細普查，識別它們不同亞型之間的細微分子差異。

RGCs將視覺數據從眼睛傳遞給大腦，之前已經識別了30種RGCs亞型，利用單細胞RNA測序，研究小組分析了6225個來自新生小鼠左右眼的單個RGCs，檢測到大約5000個表達基因，通過聚類算法運行所得數據，將細胞分類為40個子類型。

由神經科學系教授Ephraim F. Trakhtenberg博士領導的這項研究發(fā)表于《Nature Communications》，他們?yōu)樯飳W領域的一大類問題提供了新參考：細胞的亞型或類型由什么決定？

哺乳動物中樞神經系統(tǒng)高度復雜，涉及許多專門的神經元類型和亞型以及它們之間的相互作用。研究小組之所以選擇調查RGCs，是因為與其他主要神經元類型相比，它們是迄今為止鑒定出最多亞型的一類細胞。并且，其他視網膜細胞類型（例如，光感受器）已經在單細胞水平上被廣泛研究了。因此，研究人員希望測定RGCs亞型之間的分子差異，并找到它們的獨特標記。

除了鑒定新RGC亞型和生物標記，研究人員還指出了將細胞分化為這些亞型所需的基因表達變異量，并提出了從細胞型群體到亞型群體的層次結構。目前，該研究公開數據可訪問UConn Health網站“RGC Subtypes Gene Browser”免費獲取。

原文檢索：Single cell transcriptome profiling of retinal ganglion cells identifies cellular subtypes