深圳子科生物報道:

人類誘導多能干細胞（iPSCs）具有公認且廣泛的治療前景，但是有關它的“突變載量”仍尚未完全表征。

全球范圍已有超過1000種iPSCs細胞系被建立。iPSCs來自體細胞重編程，像皮膚細胞這種，很可能由于常年暴露于陽光和紫外線輻射而積累許多非遺傳性的體細胞突變（somatic mutations）。雖然，之前有研究部分表征過iPSCs細胞中的體細胞突變，但是我們對這些突變的確切載量還不確定。

“為了真正有效利用iPSCs，我們需要在個體基礎上檢測到每株iPSCs的體細胞突變，方可以對特定人類疾病和/或移植療法模型進行優(yōu)劣排序，”加州大學圣地亞哥分校基因組醫(yī)學研究所主任、文章一作Kelly A. Frazer博士說。

本周他們在《Cell Reports》雜志發(fā)表了一篇文章，研究人員使用全基因組測序、轉錄組和表觀遺傳組數(shù)據(jù)對來自iPSCORE資源和WiCell的18株iPSCs（皆為非盈利性干細胞系）的全基因組序列進行了詳細盤查。

除了擴大范圍描述來自親本細胞的克隆突變和拷貝數(shù)改變（染色體重復或缺失），研究者還表征了另外兩種新突變類型：親本細胞中因紫外線引起的突變，以及親本細胞中原本不存在，但是在iPSCs重編程亞克隆中出現(xiàn)的突變。

研究人員發(fā)現(xiàn)，雖然絕大多數(shù)突變位于關閉染色質相關的表觀遺傳區(qū)，然而，在iPSCs重編程過程中，亞克隆突變與活性染色質以及基因表達改變關聯(lián)也比較大。

原文檢索：Insights into the Mutational Burden of Human Induced Pluripotent Stem Cells from an Integrative Multi-Omics Approach