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調(diào)節(jié)RNA剪接研究的一個(gè)通用的CRISPR遺傳調(diào)控平臺(tái)


深圳子科生物報(bào)道:RNA剪接是真核細(xì)胞基因表達(dá)中非常重要的一個(gè)生物過程,通過RNA剪接,可以產(chǎn)生許多具有功能的、帶有編碼信息的mRNA(信使RNA),對(duì)生物發(fā)育及進(jìn)化至關(guān)重要。選擇性剪接是使多細(xì)胞生物蛋白質(zhì)組多樣化的主要機(jī)制。新一代測(cè)序(NGS)已經(jīng)發(fā)現(xiàn)前所未有數(shù)量的剪接異構(gòu)體,其中許多與各種生理和病理?xiàng)l件有關(guān),如50%以上致病突變會(huì)影響剪接,因此有效并且精確調(diào)節(jié)剪接方法與許多人類疾病治療相關(guān)。然而,絕大多數(shù)剪接事件的功能仍然難以捉摸,剪接過程本身可以與其他重要的分子過程緊密結(jié)合,包括促進(jìn)轉(zhuǎn)錄和翻譯。

來自上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院、中國(guó)科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院健康科學(xué)研究所常興研究員發(fā)表了題為“Genetic Modulation of RNA Splicing with a CRISPR Guided Cytidine Deaminase”的文章,發(fā)現(xiàn)CRISPR(Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats)引導(dǎo)的胞苷脫氨酶能夠有效地調(diào)控各種形式mRNA(信使核糖核酸)剪接,從而為調(diào)節(jié)RNA剪接和糾正與人類疾病中異常剪接相關(guān)的突變提供了一個(gè)通用遺傳平臺(tái)。

這項(xiàng)研究通過CRISPR引導(dǎo)的胞苷脫氨酶進(jìn)行了RNA剪接的遺傳調(diào)控,公布在10月18日Molecular Cell雜志上。

CRISPR基因編輯技術(shù)由可以切割基因的蛋白Cas9和帶著Cas9在基因組精確定位的向?qū)NA(核糖核酸)組成。用滅活版本的Cas9蛋白與向?qū)NA結(jié)合,改造出具有精確定位功能的CRISPR技術(shù),可用來關(guān)閉或打開幾乎任何單個(gè)基因,或者精細(xì)地調(diào)控它們的活躍程度。

常興研究員課題組發(fā)現(xiàn)CRISPR引導(dǎo)的胞苷脫氨酶(TAM,targeted-AID mediated mutagenesis,即靶向AID介導(dǎo)的突變)能夠有效地調(diào)控各種形式的mRNA剪接。通過將5'或3'剪接位點(diǎn)上的不變體鳥苷轉(zhuǎn)化為腺嘌呤,TAM誘導(dǎo)外顯子跳躍,激活替代剪切位點(diǎn),在相互排斥的外顯子之間切換,或?qū)е履繕?biāo)內(nèi)含子保留。相反,TAM促進(jìn)下游外顯子包含,使胞苷突變成聚嘧啶束上的胸腺嘧啶。

應(yīng)用這一方法,研究人員在患者源性多能干細(xì)胞(IPSCs)中恢復(fù)了突變DMD基因的開放閱讀框架和其生物學(xué)功能。

這項(xiàng)研究提示,由CRISPR引導(dǎo)的胞苷脫氨酶為調(diào)節(jié)RNA剪接和糾正與人類疾病中異常剪接相關(guān)的突變提供了一個(gè)通用的遺傳平臺(tái)。

原文標(biāo)題:

Genetic Modulation of RNA Splicing with a CRISPR Guided Cytidine Deaminase

https://www.cell.com/molecular-cell/fulltext/S1097-2765(18)30741-X

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