子科生物報道：有些兒童患有至少一種慢性病，依賴呼吸機等工具，需要多名?？漆t(yī)生的照顧和大量醫(yī)療保健資源，這些患兒被稱為醫(yī)療上復雜的兒童（Children with medical complexity，CMC）。大多數(shù)患兒都被懷疑有遺傳原因，但無法通過常規(guī)的基因檢測發(fā)現(xiàn)。

近日，多倫多病童醫(yī)院Robin Hayeems領(lǐng)導的研究團隊開展了一項隊列研究，以確定基因組測序作為CMC診斷檢測的分析和臨床有效性。他們發(fā)現(xiàn)，近三分之一的患兒可通過基因組測序獲得診斷結(jié)果。這項成果發(fā)表在《JAMA Network Open》上。

Hayeems和她的同事在論文中寫道：“這項研究表明，基因組測序具有很高的分析和臨床有效性，能夠為患兒帶來新的診斷結(jié)果。”她們認為，基因組測序有望成為CMC的一線遺傳檢測。

在這項研究中，研究人員對49個家庭中的138人進行基因組測序，其中包括40個trio家系。由于患兒平均接受過四個常規(guī)的遺傳檢測，因此他們的一些遺傳變異是已知的，大多數(shù)是良性或不明意義的變異。測序分析確定了全部124個此類變異，這表明基因組測序具有很高的分析有效性。

對于49名先證者，也就是家族中最先發(fā)現(xiàn)患有特定疾病的個體，15名在基因組測序后獲得了新的分子遺傳學診斷結(jié)果，診斷率達到30.6%。

例如，一名患兒X染色體上的KDM6A基因發(fā)生了單外顯子重復，導致Kabuki綜合征的發(fā)生。這個突變是母系遺傳的，但之前通過染色體芯片分析、外顯子組測序或MLPA（多重連接依賴式探針擴增）技術(shù)都沒有檢測到。

三名兒童患有新的遺傳病，包括與RAC3相關(guān)的疾病以及兩種新的常染色體顯性神經(jīng)發(fā)育綜合征。另外九名兒童患有超罕見的遺傳病，或具有一種或多種非典型特征的極罕見遺傳病。

對于其中的五項診斷結(jié)果，目前都有相關(guān)的管理建議或干預措施，而一名患有癲癇性腦病的兒童已開始接受靶向治療。此外，四項診斷結(jié)果具有生殖咨詢意義，因為同胞兄弟的復發(fā)風險至少為25%。其他疾病則是由新發(fā)突變引起，且復發(fā)風險低。

研究人員指出，盡管這項單中心的研究存在著一些限制，但他們的結(jié)果支持將基因組測序作為醫(yī)療上復雜兒童的一線遺傳檢測?！盎蚪M測序有望增加確診CMC的比例，”她們寫道。

同時，她們在論文中補充說，RNA-seq和全基因組甲基化分析等組學工具有望進一步提高這些患者的診斷率。

原文檢索

Genome Sequencing as a Diagnostic Test in Children With Unexplained Medical Complexity

JAMA Netw Open. 2020;3(9):e2018109. doi:10.1001/jamanetworkopen.2020.18109