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子科生物報(bào)道:王永明/王紅艷/李繼喜團(tuán)隊(duì)合作CRISPR/Cas9被譽(yù)為“基因魔剪”,是基因編輯的利器,在基礎(chǔ)研究、農(nóng)業(yè)育種和基因治療等領(lǐng)域得到了廣泛應(yīng)用。CRISPR/Cas9工具還存在很多局限。常用的SpCas9編輯范圍廣,活性高,但是基因大,給病毒載體遞送帶來困難。常用的SaCas9基因小,但是編輯范圍小。其他Cas9活性低,應(yīng)用較少。為了找到理想的Cas9工具酶,復(fù)旦大學(xué)王永明課題組建立了大規(guī)模篩選Cas9的平臺(tái),對自然界中數(shù)百種Cas9進(jìn)行系統(tǒng)性篩查。2020年該課題組篩選到了SauriCas9,具備活性高、編輯范圍廣、基因小等優(yōu)點(diǎn),但是精準(zhǔn)性不理想,介于SpCas9和SaCas9之間。
2021年3月12號,王永明課題組聯(lián)合王紅艷和李繼喜課題組在《核酸研究》(Nucleic Acids Research)上發(fā)表了題為“Discovery and engineering of small SlugCas9 with broad targeting range and high specificity and activity”的研究論文。論文中,經(jīng)過研究者鑒定和改造,開發(fā)出SlugCas9-HF工具酶,性能突出。它識別簡單的NNGG PAM,具備活性高、精準(zhǔn)性高、編輯范圍廣、基因小等優(yōu)點(diǎn)。研究者同時(shí)還開發(fā)出ShaCas9、SlutrCas9、Sa-SlugCas9等工具。為了方便研究人員選擇合適的工具酶使用,作者對本團(tuán)隊(duì)開發(fā)的7種工具酶和SaCas9的活性和精準(zhǔn)性進(jìn)行了比較。綜合看,SlugCas9-HF在編輯活性、精準(zhǔn)性和編輯范圍都具有優(yōu)勢。
該研究的第一作者胡子英博士興奮地說:“我們后繼工作對SlugCas9-HF和SpCas9的活性進(jìn)行了比較,它們活性沒有差異。也就是說SlugCas9-HF兼具了SpCas9和SaCas9的優(yōu)點(diǎn)。這是我們一直尋找的理想工具酶,它在很多場景都可以取代SpCas9和SaCas9。我們還找到很多有優(yōu)點(diǎn)的工具酶,將陸續(xù)與同行分享?!?br>
胡子英博士和張成東博士是論文的共同第一作者,王永明教授、王紅艷教授和李繼喜教授是論文的共同通訊作者。
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