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子科生物報道:3月5日,國際學術(shù)期刊Protein & Cell 以封面論文的形式發(fā)表了中國科學院分子細胞科學卓越創(chuàng)新中心(生物化學與細胞生物學研究所)李勁松研究組的研究成果“ Epigenetic integrity of paternal imprints enhances the developmental potential of androgenetic haploid embryonic stem cells ”。這項工作首次實現(xiàn)小鼠孤雄單倍體胚胎干細胞在體外培養(yǎng)過程中穩(wěn)定維持父源印記的表觀完整性,并進一步提升了該細胞支持半克隆胚胎發(fā)育的潛能。
2008年,Austin Smith團隊建立了添加Mek1/2抑制劑和Gsk3β抑制劑(2i)的胚胎干細胞(ESCs)培養(yǎng)環(huán)境,這種培養(yǎng)基可以使體外培養(yǎng)的小鼠胚胎干細胞獲得較好的多能性(pluripotency),極大的推動了小鼠胚胎干細胞研究進程。而然,隨著高通量測序技術(shù)的發(fā)展,對于2i培養(yǎng)環(huán)境的細胞進行甲基化測序后發(fā)現(xiàn),由于對Mek1/2信號通路的抑制,這種細胞中的DNA甲基化模式受到了明顯的抑制,其中也包括印記調(diào)控區(qū)域的甲基化模式,進而嚴重降低了細胞的發(fā)育潛能。
2012年,李勁松研究組利用2i培養(yǎng)體系建立了孤雄單倍體胚胎干細胞(又稱為類精子干細胞),該細胞可以替代精子支持小鼠胚胎的發(fā)育產(chǎn)生半克隆小鼠。但在2i培養(yǎng)環(huán)境中,類精子干細胞的印記調(diào)控區(qū)域DNA甲基化會在培養(yǎng)過程中逐漸丟失,嚴重降低了半克隆小鼠的發(fā)育潛能(2%的半克隆胚胎發(fā)育成健康個體),極大的限制了這項技術(shù)的應用和發(fā)展。2015年,通過在類精子干細胞中敲除兩個父源印記調(diào)控區(qū)域(H19-DMR和IG-DMR)來模擬其甲基化,極大的提高了半克隆小鼠的發(fā)育潛能(20%的出生率),但是這種遺傳敲除的策略會給其后的應用帶來不確定因素。
為了解決上述問題,研究人員嘗試對于類精子干細胞的建系和培養(yǎng)過程進行優(yōu)化,試圖在體外培養(yǎng)過程中實現(xiàn)父源印記表觀修飾的穩(wěn)定維持。為此,研究人員對比分析了三種常用的小鼠胚胎干細胞培養(yǎng)環(huán)境(S/L,2i/L和a2i/L)的優(yōu)缺點,并選擇a2i/L培養(yǎng)環(huán)境進行進一步的改造和優(yōu)化,最終建立了基于a2i/L培養(yǎng)環(huán)境的兩步建系的策略(TSa2i)。該策略建立的類精子干細胞在接近60代的培養(yǎng)過程中可以穩(wěn)定維持父源印記表觀修飾的完整性,同時大幅提高了健康半克隆小鼠的出生效率(最高可以達到30%)。
此外,研究人員還發(fā)現(xiàn)培養(yǎng)到后期代數(shù)的類精子干細胞印記甲基化水平進一步升高,并伴隨體內(nèi)發(fā)育能力的增強。究其原因,研究人員發(fā)現(xiàn)TSa2i的類精子干細胞H19-DMR的甲基化水平表現(xiàn)出異質(zhì)性,大部分細胞維持高甲基化而少量細胞會逐漸丟失甲基化。有意思的是,H19-DMR甲基化水平高的細胞較低甲基化水平的細胞有增殖的優(yōu)勢,從而使這些細胞在整體中數(shù)量增多,導致類精子干細胞能穩(wěn)定維持印記甲基化并出現(xiàn)后期代數(shù)細胞甲基化水平升高的現(xiàn)象。
基因組印記對于胚胎干細胞體內(nèi)發(fā)育能力起決定性作用,這項工作首次建立了能長期穩(wěn)定維持雄性印記的類精子干細胞,并提升其發(fā)育潛能,為體內(nèi)遺傳篩選提供強大的工具,該研究也為建立穩(wěn)定維持印記的孤雌單倍體胚胎干細胞提供了新的思路。
分子細胞卓越中心博士生張紅玲,博士后李元元和博士生馬永健為本文共同第一作者。李勁松研究員為本文的通訊作者。該研究得到分子細胞卓越中心GTP研發(fā)中心,動物實驗技術(shù)平臺和細胞分析技術(shù)平臺的大力支持。該工作得到中國科學院、基金委、科技部、上海市科委等經(jīng)費支持。
模式圖:父源印記的表觀遺傳完整性增強了AG-haESCs的發(fā)育潛能
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