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尿液中的exRNA是有用的生物標(biāo)志物


深圳子科生物報(bào)道:麻省總醫(yī)院的研究人員發(fā)現(xiàn),尿液中的細(xì)胞外RNA(exRNA)可能是兩種最常見(jiàn)的肌營(yíng)養(yǎng)不良癥的生物標(biāo)志物,這些分子可無(wú)創(chuàng)地為患者和醫(yī)生提供藥物治療信息。結(jié)果發(fā)表在《Nature Communications》,首次表明,尿液中的exRNA可用于監(jiān)測(cè)非直接影響泌尿系統(tǒng)的疾病。 
“方便、無(wú)痛和相對(duì)低成本的檢驗(yàn)可以促進(jìn)藥物開(kāi)發(fā),繞過(guò)侵入多處肌肉組織的生物活檢,”文章通訊作者神經(jīng)內(nèi)科教授Thurman Wheeler說(shuō)。“尿液exRNA監(jiān)測(cè)預(yù)測(cè)超前于目前臨床表現(xiàn)出來(lái)的肌肉功能,告知醫(yī)患所需的藥物劑量,并盡可能地提早確定是否需要調(diào)整劑量,這對(duì)于現(xiàn)有的侵入性肌肉活檢來(lái)說(shuō)是不可能的?!?br />
有幾種類型的肌營(yíng)養(yǎng)不良,表型都是進(jìn)行性肌肉無(wú)力和肌肉量減少。杜氏肌營(yíng)養(yǎng)不良(DMD)是最常見(jiàn)的,癥狀通常始于5歲以下。強(qiáng)直性肌營(yíng)養(yǎng)不良(DM)是成年人最常見(jiàn)的發(fā)病形式,有DM1和DM2兩種表型,每種由不同基因突變引起。在DMD中,突變影響抗肌萎縮蛋白(dystrophin)基因,DM1相關(guān)突變是DMPK,DM2則是CNBP基因,后兩種都涉及多核苷酸重復(fù),導(dǎo)致RNA分子異常加工。

DM1突變影響RNA剪接(從RNA分子中去除非編碼片段)。一個(gè)基因通??梢援a(chǎn)生幾種不同蛋白,其差異來(lái)自不同的RNA剪接模式。DM1突變干擾幾種蛋白質(zhì)的RNA剪接,肌肉活檢RNA剪接變異版本分析已被用于診斷患者疾病嚴(yán)重程度,在動(dòng)物模型中也用來(lái)指示潛在治療是否可及它們的分子靶標(biāo)。最近針對(duì)DM1藥物的臨床試驗(yàn)僅限于成人患者,部分原因是出于需要反復(fù)進(jìn)行肌肉活檢的關(guān)系。

血液和尿液等體液中的微囊泡攜帶和運(yùn)輸exRNA,內(nèi)容物包含信使、非編碼和微RNA,并可以反應(yīng)突變、缺失等分子變異??茖W(xué)家們已經(jīng)在患者血液中發(fā)現(xiàn)了一些肌營(yíng)養(yǎng)不良相關(guān)RNA和蛋白質(zhì)生物標(biāo)志物。從受DM1影響的骨骼肌和心肌組織中提取exRNA似乎不太可能,但是流經(jīng)這些組織的exRNA通過(guò)腎過(guò)濾系統(tǒng)進(jìn)入尿液以后,是如此容易接近。

因此,Wheeler團(tuán)隊(duì)試圖對(duì)來(lái)自血液和尿液的微囊泡進(jìn)行分析以篩查關(guān)聯(lián)DM1突變的exRNA。

在這項(xiàng)研究中,他們總共確定了10種不同的轉(zhuǎn)錄本在DM1患者體內(nèi)交替剪接,其中大多數(shù)與患者肌肉中的一樣。根據(jù)這10種轉(zhuǎn)錄本的復(fù)合生物標(biāo)志物,可以100%準(zhǔn)確地區(qū)分DM1患者和其他未受影響的對(duì)照組。他們采集了DM1患者幾個(gè)月內(nèi)的尿液樣本,結(jié)果重復(fù)性很高,可以準(zhǔn)確地反應(yīng)疾病狀態(tài)和治療反應(yīng)。

隨著液體活檢RNA剪接分析方法進(jìn)步,研究人員發(fā)現(xiàn),與尿液和血液中的exRNA相比,尿液細(xì)胞中的總RNA剪接模式并不適合做為生物標(biāo)志物,它們無(wú)法區(qū)分DM1患者和對(duì)照組。同時(shí),一些尿液exRNA轉(zhuǎn)錄本的剪接模式可以反映DM1癥狀的嚴(yán)重性,特別是一些無(wú)臨床癥狀的DM1突變攜帶者,他們尿液中的exRNA剪接模式介于有癥狀的患者和不受該疾病影響的對(duì)照志愿者。

目前,用于治療DMD的一組藥物正在進(jìn)行評(píng)估,6名未經(jīng)治療的DMD患者的尿液exRNA可以準(zhǔn)確地反應(yīng)每位患者的特定基因突變,兩名接受了eteplirsen(一種FDA批準(zhǔn)的誘導(dǎo)跳過(guò)靶外顯子的DMD藥物)治療時(shí),尿液中的exRNA指標(biāo)顯示,藥物正在抵達(dá)其分子靶點(diǎn),該證據(jù)不曾通過(guò)肌肉活檢驗(yàn)證。

“尿液exRNA是鑒定RNA剪接變異版本的一種有價(jià)值的新方法,它有助于將基因變異與幾種疾病癥狀關(guān)聯(lián),并且是以無(wú)創(chuàng)式的方法,”哈佛醫(yī)學(xué)院神經(jīng)學(xué)助理教授Wheeler說(shuō)?!斑@些發(fā)現(xiàn)支持了尿液、血液或腦脊液內(nèi)的exRNA作為生物標(biāo)志替代物的研究?!?br />
原文檢索:Analysis of extracellular mRNA in human urine reveals splice variant biomarkers of muscular dystrophies

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