深圳子科生物報道：RNA分子有許多關(guān)鍵作用：信使RNA（mRNA）幫助儲存在DNA中的遺傳信息翻譯成蛋白質(zhì)，人類細(xì)胞中mRNA約占RNA總數(shù)的5%；其他RNA分子不會被翻譯成蛋白質(zhì)，很多必須與蛋白質(zhì)相互作用，不同類型的RNA與特定蛋白質(zhì)形成高度復(fù)雜的分子機(jī)器，比如核糖體。

“RNA和蛋白質(zhì)相互作用形成一個巨大的網(wǎng)絡(luò)，但我們對這個網(wǎng)絡(luò)的確切組成還知之甚少，我們想要了解哪些蛋白質(zhì)與RNA結(jié)合，不同細(xì)胞類型或應(yīng)激條件，這個網(wǎng)絡(luò)的表現(xiàn)有何不同，現(xiàn)在，我們已經(jīng)有了一種方法，使我們能夠首次研究這些問題，”DKFZ的Jeroen Krijgsveld說。

目前為止，針對蛋白質(zhì)RNA相互作用的方法只能分析mRNAs，其他非編碼RNA（包括近兩年新發(fā)現(xiàn)的很多品種）與蛋白質(zhì)的相互作用無法利用現(xiàn)有方法檢測。然而，非編碼RNAs的數(shù)量遠(yuǎn)超mRNAs，它們的用途也相當(dāng)廣泛。

這種分析所有類型RNA與細(xì)胞蛋白質(zhì)相互作用的新工具名為XRNAX，利用它，科學(xué)家鑒定了數(shù)百種以前不知道的RNA結(jié)合蛋白，而且不僅能看到什么蛋白與RNA結(jié)合，還能看到它們的結(jié)合程度。文章還描述了當(dāng)細(xì)胞暴露于毒素時的RNA結(jié)合變化。

“利用XRNAX，我們能夠測量蛋白質(zhì)與RNA之間的所有相互作用，這是以前沒人能夠測量的，”新方法的研發(fā)者Jakob Trendel說?！暗鞍踪|(zhì)-RNA相互作用疑似與多種疾病有關(guān)，包括癌癥、肌萎縮性側(cè)索硬化癥以及HIV等病毒感染?，F(xiàn)在我們有方法好好觀察它們了。”

原文檢索：The Human RNA-Binding Proteome and Its Dynamics during Translational Arrest